O PPG em Computação Aplicada oferece bolsas de estudo fornecidas pela Capes e Fundação Araucária, cujo valor atualmente é de R$ 1.500,00. A vigência da bolsa é de 24 meses. O critério para alocação das bolsas é por meio de edital sendo que os candidatos a bolsa são classificados com base inicialmente no histórico escolar e depois considerando também seu desempenho no mestrado. As bolsas são distribuídas por ordem de classificação dos alunos.
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